Родился в 1909 году в Санкт-Петербурге. Окончил Академию художеств в 1934 году. Период с 1939 по 1946 провёл на службе в РККА.

Лукин был преподавателем, а с 1955 по 1980 годы ректором ЛВХПУ им. В. И. Мухиной (Ленинградское высшее художественно-промышленное училище, ныне Санкт-Петербургская художественно-промышленная академия имени А. Л. Штиглица).

Участник обороны Ленинграда, Яков Николаевич стал одним из авторов мемориального комплекса на Серафимовском кладбище, сооружавшегося в период с 1957 по 1965 годы. В этот же период Лукин работал над проектом реконструкции Финляндского вокзала. Новый вокзал был введён в строй 1960 году. Некоторое время Лукин возглавлял Санкт-Петербургский Союз архитекторов.

Скончался в 1995 году в Павловске.