Родился в 1879 году в Санкт-Петербурге. Внук зодчего Н. Л. Бенуа, он закончил Академию художеств в 1904 году, был активным деятелем «Мира искусства». В своей творческой карьере занимался архитектурой, живописью, графикой и музейным делом. Лансере – принципиальный сторонник неоклассицизма

В дореволюционный период своей работы Николай Евгеньевич успел принять участие в создании нескольких образцов петербургской неоклассики. Это особняк М. А. Новинской на Песочной набережной и особняк В. П. Кочубея в Царском селе. Это памятник Петру I и часовня у Сампсониевского собора, метеорологический павильон на Малой Конюшенной улице и Школа народного искусства на набережной канала Грибоедова (напротив Спаса на Крови).

В послереволюционный период он выходит в ряд первых зодчих нового времени. В конце 1920-х – первой половине 1930-х Лансере создаёт комплекс зданий «Полиграфмаша» на набережной реки Карповки, а также много проектирует для Института экспериментальной медицины.

В 1929 году Николай Евгеньевич принял участие в международном архитектурном конкурсе, его проект маяка-памятника Христофору Колумбу в Сан-Доминго заслужил почётный отзыв и диплом.

Лансере был дважды арестован ОГПУ по обвинениям в шпионаже. Во время первого ареста, в 1932 году, работал в ОКТБ-12 (особом конструкторско-техническом бюро), располагавшемся в тюрьме ОГПУ на ул. Воинова. Вплоть до освобождения в 1935 году работал над фасадами зданий для ОГПУ и внутренней отделкой правительственных дач.

После второго ареста в 1938 году был несколько раз этапирован в различные тюрьмы и лагеря, скончался в 1942 году в саратовской тюрьме.