Родился 22 сентября 1937 года в Ленинграде. После окончания в 1960 году Ленинградского театрального института имени А. Н. Островского стал театральным художником. Работал в Малом театре оперы и балета, в Живописно-скульптурном комбинате, Комбинате графических работ Художественного фонда РСФСР. С 1963 по 1966 год был главным художником Ленинградского театра драмы и комедии (ныне — Театр «На Литейном»), затем с 1966 по 1972 год — главным художником Театра имени В. Ф. Комиссаржевской, а с 1972 года является главным художником Большого драматического театра.

Эдуард Кочергин оформил более двухсот спектаклей в России и за рубежом, в том числе на сценах МХТ им. А. П. Чехова, Малого театра, Театра им. В. В. Маяковского, Театра им. Моссовета, в «Современнике», «Театре на Таганке», Театре Комедии, Театре им. В. Ф. Комиссаржевской, Малом драматическом театре – Театре Европы и многих других.

Эдуард Кочергин имеет знание народного художника России и является действительным членом Российской Академии художеств. Он стал лауреатом Государственных премий, кавалером Ордена «За заслуги перед Отечеством» III и IV степени, а также удостоен целого ряда престижных международных премий.

С начала века Эдуард Кочергин занимается также писательской деятельностью. Его первые автобиографические книги «Крещёные крестами» и «Ангелова кукла» вызвали неподдельный интерес и были отмечены книжными премиями «Национальный бестселлер» и С. Довлатова. В 2014 году Э. Кочергин стал лауреатом премии «Театральный роман» за книгу «Записки планшетной крысы», а в 2016 году — литературной премии имени Н. В. Гоголя за «Завирухи Шишова переулка».

Кочергин, Э. С. Ангелова кукла: рассказы рисовального человека. - Санкт-Петербург : Вита Нова, 2013. - 405 с.

Кочергин, Э. С. Дети моста Лейтенанта Шмидта : рассказы. - Санкт-Петербург : Вита Нова, 2021. – 235 с.

Кочергин, Э. С. Житие Лидки Петроградской : рассказы. - Санкт-Петербург : Вита Нова, 2022. – 260 с.

Кочергин, Э. С. Завирухи Шишова переулка: василеостровские притчи. - Санкт-Петербург : Вита Нова, 2015. – 163 с.

Кочергин, Э. С. Записки планшетной крысы. - Санкт-Петербург : Вита Нова, 2014. – 341 с.

Кочергин, Э. С. Категории композиции. Категории цвета: практические исследования основных понятий : учебное пособие для студентов, осваивающих дисциплину "Основы композиции" при получении высшего образования по специальности "Сценография". - Санкт-Петербург : Вита Нова, 2017. – 156 с.

Кочергин, Э. С. Крещенные крестами: записки на коленках. - Санкт-Петербург : Вита Нова, 2013. – 285 с.

Кочергин, Э. С. Россия, кто здесь крайний?: рассказы. - Санкт-Петербург : Вита Нова, 2017. – 237 с.